(1)凡符合以下报废条件的不能用于临床使用的医疗设备，应予以报废。
经检测，维修后技术性能仍无法达到临床应用基本要求。
仪器设备老化，技术性能落后，超过使用年限。
严重污染环境，危害患者或工作人员安全及健康，改造费用昂贵的。
虽可以修复，但维修费用过大，已不值得修理的。
计量器具按“计量器具管理制度”规定，已无法满足计量基本标准的要求。
凡是国家明文禁止使用的医疗器械及相关的设备
(2)申请报废医疗（含教学、科研）设备，由使用部门提出，医学工程部（处、科、室）登记造册，逐一填写“报废医疗设备申请表”，有相关技术部门作技术鉴定，设备主管提出调剂报废意见，财务部门办理相关手续。
(3)万元以上医疗（含教学、科研）设备的报废，按国家国有资产管理局《行政事业单位国有资产处置管理实施办法》的规定程序申报。
(4)凡减免税进口的医疗（含教学、科研）设备，除以上规定外还应按海关有关规定办理。对于可供家用设备的报废处理，应加强审核，严格控制。
(5)待报废医疗（含教学、科研）设备在未批复前应妥善保管，已批准的报废的大型医疗设备应将其可利用部分拆下，折价入账，入库保管，合理利用。
(6)经批准报废的医疗（含教学、科研）设备，使用部门和个人不得自行处理，一律交回设备主管部门统一处理。如有违反者应予追查，并交主管部门处理。
(7)已批准报废的医疗（含教学、科研）设备在处理后，应及时办理财务销账手续，其残值收益应列入医疗设备更新费、改造基金项目专项使用。